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<title>DNA-Leiter</title>

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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">DNA-Leiter</span></h1>

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<p>Eine <b>DNA-Leiter</b> ist ein Gemisch von <a href="Desoxyribonukleins%C3%A4ure" title="Desoxyribonukleinsäure">DNA</a>-Strängen bekannter unterschiedlicher Länge, das zur Größenbestimmung von DNA in einer Probe als <a href="Komigrationsstandard" title="Komigrationsstandard">Komigrationsstandard</a> (Längenstandard, Größenmarker) in einer <a href="Agarose-Gelelektrophorese" title="Agarose-Gelelektrophorese">Agarose-Gelelektrophorese</a> eingesetzt wird. Aus der bekannten Menge der DNA im Komigrationsstandard kann außer der Länge eine schätzungsweise <a href="Quantifizierung" title="Quantifizierung">Quantifizierung</a> der DNA in einer Probe erreicht werden. Des Weiteren wird der Begriff <i>DNA-Leiter</i> für ein charakteristisches Längenmuster einer Agarose-Gelelektrophorese von <a href="Apoptose" title="Apoptose">apoptotischen</a> Zellen gebraucht.

</p><p>Eine Standard-DNA-Leiter enthält Fragmente zwischen etwa 100 <a href="Basenpaar" title="Basenpaar">Basenpaaren</a> und 10.000 Basenpaaren. Spezielle DNA-Leitern können im Bereich besonders langer oder besonders kurzer DNA-Fragmente ihren Schwerpunkt haben und erleichtern damit eine genauere Größenbestimmung. Analog gibt es auch Leitern definierter Größe aus einzel- und doppelsträngiger <a href="Ribonukleins%C3%A4ure" title="Ribonukleinsäure">RNA</a>.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Beispiel">Beispiel</h2></div>

<p>In der Abbildung rechts ist ein Beispiel für eine DNA-Leiter dargestellt. Es handelt sich um ein Foto eines typischen <a href="Agarosegel" class="mw-redirect" title="Agarosegel">Agarosegels</a> (1 % Agarose) im <a href="UV-Licht" class="mw-redirect" title="UV-Licht">UV-Licht</a>. Die hellen Banden sind die DNA-Fragmente, die durch Färbung mit <a href="Ethidiumbromid" title="Ethidiumbromid">Ethidiumbromid</a> im UV-Licht rot fluoreszieren. In der ersten Spur befindet sich die DNA-Leiter, seitlich sind die Größen (bp für <a href="Basenpaar" title="Basenpaar">Basenpaare</a>) der jeweiligen Fragmente angegeben. Die DNA-Gesamtmenge der aufgetragenen Leiter beträgt 1 µg. In der zweiten und dritten Spur wurden DNA-Proben aufgetrennt. Die erste Probe enthält vier verschieden große Fragmente von etwa 4500, 2500, 1500 und 1300 bp. Die zweite Probe enthält ein Fragment von 8000 und eines von 2500 bp. Anhand der intensiveren Banden ist zu erkennen, dass die erste Probe etwas mehr DNA enthält als die zweite Probe.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Molmassenbestimmung">Molmassenbestimmung</h2></div>

<div class="hauptartikel" role="navigation"><span class="hauptartikel-pfeil" title="siehe" aria-hidden="true" role="presentation">→ </span><i><span class="hauptartikel-text">Hauptartikel</span>: <a href="SDS-PAGE#Molmassenbestimmung" title="SDS-PAGE">„Molmassenbestimmung“ im Artikel SDS-PAGE</a></i></div>

<p>Der mathematische Zusammenhang zwischen der Anzahl der Basenpaare (näherungsweise auch der Molmasse) und der Wegstrecke im Agarosegel ist <a href="Logarithmus" title="Logarithmus">logarithmisch</a>. Durch einen <a href="Logarithmusfunktion" class="mw-redirect" title="Logarithmusfunktion">halblogarithmische</a> Darstellung in einem <a href="Funktionsgraph" title="Funktionsgraph">Graphen</a> kann die Korrelation linearisiert werden.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="DNA-Leiter_im_Zusammenhang_mit_Apoptose">DNA-Leiter im Zusammenhang mit Apoptose</h2></div>

<p>Im Zusammenhang mit dem programmierten Zelltod wird die DNA-Leiter als hoch-sensitiver Indikator für <a href="Apoptose" title="Apoptose">Apoptose</a> verwendet. Das Phänomen wurde 1980 von <a href="Andrew_H._Wyllie" class="mw-redirect" title="Andrew H. Wyllie">Andrew H. Wyllie</a> von der University of Edinburgh Medical School zuerst beschrieben.<sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p><p><a href="Endonuklease" title="Endonuklease">Endonukleasen</a> spalten im Verlauf der Apoptose genomische DNA zwischen den <a href="Nukleosom" title="Nukleosom">Nukleosomen</a> (Linker-Region) und produzieren dabei DNA-Fragmente mit einer Länge von etwa 180 Basenpaaren. Die DNA-Leiter kommt dadurch zustande, dass die DNA im Bereich der Nukleosomen vor dem Abbau durch die <a href="Desoxyribonuklease" title="Desoxyribonuklease">DNase</a> geschützt ist, wohingegen die Zwischenbereiche hydrolysiert werden können. Bei der Nekrose hingegen kommt es beim DNA-Abbau zu Fragmenten zufälliger Größe, die in einem Agarosegel als „Schmier“ auftreten. Die Darstellung der „Apotoseleiter“ ist deshalb eine sensitive Methode um Apoptose vom ischämischen oder toxischen Zell-Tod abzugrenzen.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Literatur">Literatur</h2></div>

<ul><li><a href="Friedrich_Lottspeich" title="Friedrich Lottspeich">Friedrich Lottspeich</a>, Joachim W. Engels (Hrsg.): <i>Bioanalytik</i>. 2. Auflage. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2006, ISBN 978-3-8274-1520-2.</li>

<li>Cornel Mülhardt: <i>Der Experimentator: Molekularbiologie/Genomics</i>. Sechste Auflage. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2008, ISBN 3-8274-2036-9.</li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a></span> <span class="reference-text">Wyllie AH: <cite class="lang" lang="en" dir="auto" style="font-style:italic">Glucocorticoid-induced thymocyte apoptosis is associated with endogenous endonuclease activation</cite>. In: <cite class="lang" lang="en" dir="auto" style="font-style:italic"><a href="Nature" title="Nature">Nature</a></cite>. <span style="white-space:nowrap">Band<span style="display:inline-block;width:.2em"> </span>284</span>, <span style="white-space:nowrap">Nr.<span style="display:inline-block;width:.2em"> </span>5756</span>, 10. April 1980, <a href="Internationale_Standardnummer_f%C3%BCr_fortlaufende_Sammelwerke" title="Internationale Standardnummer für fortlaufende Sammelwerke">ISSN</a> <span style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://zdb-katalog.de/list.xhtml?t=iss%3D%220028-0836%22&key=cql">0028-0836</a></span>, <span style="white-space:nowrap">S.<span style="display:inline-block;width:.2em"> </span>555–556</span>, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<span class="uri-handle" style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1038/284555a0">10.1038/284555a0</a></span>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/6245367?dopt=Abstract">PMID 6245367</a> (englisch, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.nature.com/articles/284555a0">nature.com</a>).<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rfr_id=info:sid/de.wikipedia.org:DNA-Leiter&rft.atitle=Glucocorticoid-induced+thymocyte+apoptosis+is+associated+with+endogenous+endonuclease+activation&rft.au=Wyllie+AH&rft.date=1980-04-10&rft.doi=10.1038%2F284555a0&rft.genre=journal&rft.issn=0028-0836&rft.issue=5756&rft.jtitle=Nature&rft.pages=555-556&rft.pmid=6245367&rft.volume=284" style="display:none"> </span></span>

</li>

</ol></div><div><div class="zim-footer">

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